Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTA1P68133 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms