Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms