Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00313P59037 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms