Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms