Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms