Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PGGT1BP53609 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PGGT1BP53609 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PGGT1BP53609 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PGGT1BP53609 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PGGT1BP53609 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PGGT1BP53609 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PGGT1BP53609 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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