Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms