Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPAP49450 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms