Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC1P48995 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms