Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A3P48751 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC4A3P48751 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms