Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA4P43681 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA4P43681 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms