Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms