Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IL3RAP26951 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms