Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMLP26374 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMLP26374 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHMLP26374 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMLP26374 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMLP26374 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms