Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms