Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms