Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms