Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms