Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGCP20142 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGCP20142 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGCP20142 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGCP20142 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGCP20142 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGCP20142 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGCP20142 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGCP20142 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGCP20142 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGCP20142 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGCP20142 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms