Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PTPRAP18433 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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