Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms