Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRAFP15056 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRAFP15056 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRAFP15056 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRAFP15056 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRAFP15056 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRAFP15056 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms