Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms