Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BMP4P12644 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BMP4P12644 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMP4P12644 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms