Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCF2P10911 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCF2P10911 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCF2P10911 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCF2P10911 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCF2P10911 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCF2P10911 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCF2P10911 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCF2P10911 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCF2P10911 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCF2P10911 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCF2P10911 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms