Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GLI4P10075 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GLI4P10075 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GLI4P10075 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GLI4P10075 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms