Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms