Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms