Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms