Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOP08100 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOP08100 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOP08100 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOP08100 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOP08100 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms