Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFLP07196 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms