Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms