Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PF4P02776 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PF4P02776 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PF4P02776 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PF4P02776 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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