Protein–RNA interactions for Protein: O75477

ERLIN1, Erlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1O75477 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERLIN1O75477 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms