Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX3O75364 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX3O75364 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX3O75364 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms