Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms