Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCN2BO60939 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms