Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPLO60437 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPLO60437 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPLO60437 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms