Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLIN1O60240 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLIN1O60240 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms