Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL13O43927 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms