Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms