Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms