Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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