Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms