Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms