Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms