Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms