Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACOD1A6NK06 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms