Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WTIPA6NIX2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WTIPA6NIX2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WTIPA6NIX2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WTIPA6NIX2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WTIPA6NIX2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WTIPA6NIX2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
WTIPA6NIX2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms