Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms